Histopathology data for Gapvd1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET M #7 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #8 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #6 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET F #8 Lung [MA:0000415]
HET M #7 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #6 Esophagus [MA:0000352]
HET F #8 Tongue [MA:0000347]
HET F #6 Heart [MA:0000072]
HET F #6 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #7 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #5 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #6 Skin [MA:0000151]
HET F #6 Liver [MA:0000358]
HET F #6 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Eye [MA:0000261] 2 0 unilateral Unilateral micro or anophthalmia
HET F #6 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET F #8 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #7 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET M #5 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #5 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #6 Tibia [MA:0001361]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #5 Small intestine [MA:0000337]
HET M #5 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #7 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #8 Ear [MA:0000236]
HET M #5 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #7 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #5 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET M #7 Lung [MA:0000415]
HET M #5 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #5 Eye [MA:0000261] 1 0 unilateral Focal unilateral retinal disorganization (consistent with retinal dysplasia)
HET M #7 Lymph node [MA:0000139]
HET F #8 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #7 Tongue [MA:0000347]
HET M #5 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Thyroid
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Thyroid
HET M #5 Skin [MA:0000151]
HET M #7 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #6 Thyroid
HET F #6 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Thyroid
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #6 Lymph node [MA:0000139]
HET M #7 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET M #5 Lymph node [MA:0000139]
HET F #6 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET F #6 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #6 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #8 Femur [MA:0001359]
HET F #8 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #8 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #7 Tibia [MA:0001361]
HET M #5 Testis [MA:0000411]
HET M #5 Tibia [MA:0001361]
HET M #7 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #7 Brain [MA:0000168]
HET F #8 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #6 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #8 Brain [MA:0000168]
HET F #8 Skin [MA:0000151]
HET F #8 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET M #7 Tooth [MA:0000348]
HET M #5 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #5 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #8 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #7 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 1 0 mild neutrophilic gastritis at the limiting ridge
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET F #8 Esophagus [MA:0000352]
HET M #5 Lung [MA:0000415] 1 0 Focally extensive subpleural histiocytic and neutrophilic pneumonia with fibrin exudation and intralesional eosinophilic crystals
HET M #7 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #6 Femur [MA:0001359]
HET F #8 Lymph node [MA:0000139]
HET M #5 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #5 Stomach [MA:0000353]
HET F #8 Knee joint [MA:0000471]
HET F #8 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #5 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #8 Bone [MA:0001459]
HET M #7 Epididymis [MA:0000397]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #7 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET F #8 Thyroid
HET F #8 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #7 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #7 Heart [MA:0000072]
HET M #5 Trachea [MA:0000441]
HET F #6 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #8 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #8 Spleen [MA:0000141]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #7 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #8 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #7 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #6 Tooth [MA:0000348]
HET M #7 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #6 Pancreas [MA:0000120]
HET F #8 Eye [MA:0000261] 1 0 unilateral Unilateral focal retinal dysplasia
HET F #6 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #8 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET M #5 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #5 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #7 Thyroid
HET M #7 Skin [MA:0000151]
HET M #7 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #5 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET M #5 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #8 Stomach [MA:0000353]
HET F #6 Lung [MA:0000415]
HET F #6 Tongue [MA:0000347]
HET M #5 Epididymis [MA:0000397]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #7 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #5 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #6 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #7 Trachea [MA:0000441]
HET M #5 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #7 Kidney [MA:0000368]
HET M #7 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #6 Bone [MA:0001459]
HET M #3 Thyroid
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #7 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET M #7 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #8 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #8 Tibia [MA:0001361]
HET F #8 Uterus [MA:0000389]
HET M #5 Pancreas [MA:0000120]
HET F #6 Kidney [MA:0000368]
HET M #5 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #5 Thyroid
HET M #5 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #6 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #5 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET M #5 Ear [MA:0000236]
HET F #8 Pancreas [MA:0000120]
HET F #6 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #5 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #5 Kidney [MA:0000368]
HET M #5 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #6 Spleen [MA:0000141]
HET F #6 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #8 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #7 Spleen [MA:0000141]
HET F #8 Tooth [MA:0000348]
HET F #6 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET F #6 Ovary [MA:0000384]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #8 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET F #8 Ovary [MA:0000384]
HET F #6 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #7 Small intestine [MA:0000337]
HET M #5 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #6 Uterus [MA:0000389]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #6 Small intestine [MA:0000337]
HET F #6 Large intestine [MA:0000333]
HET M #7 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #7 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET M #7 Testis [MA:0000411]
HET F #6 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #5 Knee joint [MA:0000471]
HET M #5 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET M #7 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #8 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #8 Kidney [MA:0000368]
HET F #6 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #6 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #8 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #8 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #7 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter