banner
Genes Phenotypes Help, News, Blog

Histopathology data for Ppil1

Home Genes Ppil1 Histopathology

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Uterus [MA:0000389] 2 0 Uterus: Moderate, stromal edema
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #2 Liver [MA:0000358] 1 0 Liver: Minimal, focal, neutrophilic, mononuclear cellular infiltrate with associated hepatocellular necrosis
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057] 2 0 Peri-prostatic adipose tissue: Moderate, regionally extensive, neutrophilic and mononuclear steatitis
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057] 1 0 Peri-pancreatic adipose tissue: Mild, multifocal, mononuclear cellular infiltrates
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Eye [MA:0000261] 1 0 Eye, unilateral: Mild, multifocal retinal dysplasia
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Thyroid
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Mild, paracortical lymphoid hyperplasia
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET F #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Testis [MA:0000411] 2 0 Testis, unilateral: Mild to moderate, regional, tubular atrophy
HET M #2 Thyroid 1 0 Thyroid: Minimal, multifocal, follicular luminal cellular debris
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Thyroid 2 0 Thyroid: Mild to moderate, regionally extensive, degeneration and atrophy
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Eye [MA:0000261] 2 0 Eye, unilateral: Moderate, multifocal to coalescing, neutrophilic and mononuclear blepharitis Eye, unilateral: Cataract with suspected focal posterior lens capsule rupture and pigment dispersion Eye, unilateral: Focal retinal dysplasia with rosette formation
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057] 1 0 Peri-pancreatic adipose tissue: Mild, multifocal, mononuclear cellular infiltrates
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #1 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Mild, paracortical and follicular lymphoid hyperplasia
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Skin [MA:0000151] 1 0 Haired skin: Mild, focal, acanthosis with mild dermal fibrosis
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Spleen [MA:0000141] 1 0 Spleen: Extramedullary hematopoiesis, mild increase
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Thyroid
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 2 0 Spleen: Extramedullary hematopoiesis, moderate increase
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 2 0 Lymph node, mesenteric: Moderate, paracortical and follicular lymphoid hyperplasia
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Liver [MA:0000358] 1 0 Liver: Mild, multifocal, random, neutrophilic and mononuclear cellular infiltrate
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter